Социально-гигиенический мониторинг водоёмов ведомство проводило в течение двух с половиной месяцев – с 18 апреля по 29 июня. Исследовали в общей сложности 45 объектов – реки, озёра и карьеры в 88 точках.
Специалисты отобрали 342 пробы на санитарно-химические, микробиологические и паразитологические показатели. Выяснилось, что качество воды в озёре Котокель (у сёл Котокель и Черёмушки), в Байкале у села Выдрино (устье реки Снежная), в местностях Байкальский Прибой, Култушная, реках Иркут (местность Вышка), Тунка (у села Тунка), Селенга (в начале Тарбагатая), Хилок (в 1 километре от Подлопаток и Харитоново), Киран (на границе с Монголией), Чикой, на озере Малая Еравна у посёлка Ширинга и на в реке Кодун в 2 километрах от села Хоринск, не соответствует санитарным требованиям по содержанию железа.
Санитарным требованиям также не отвечает вода в Селенге в районе сёл Мурзино, Истомино, Новоселенгинска, посёлке Сотниково и 500 метрах ниже левобережных очистных сооружений «Водоканала». Кроме того, в «чёрный список» попали река Кяхтинка, озёра Торн и Карасиное у села Хурумша, Генеральское озеро и Байкал (у села Энхалук). Не только купание, но и отдых на побережье этих водоёмов и даже занятия спортом угрожают здоровью жителей Бурятии.